Всем в стране формально руководили советы народных депутатов (она так и называлась "Страна Советов" или "Советский Союз"). Ну и исполнительная власть была, как бы назначаемая этими Советами - Совет министров СССР.
Однако де факто всем руководила Коммунистическая партия Советского Союза (КПСС) ибо она смотрела за тем, кого куда назначать и кого от куда снимать. Вспомните сериал Доктор Хаус, Чейз говорит Форману "А ты нанимаешь на работу или увольняешь?" намекая тому, что ни какой он над ним не начальник.

Ну и КГБ точно так же подчинялся партии как и все остальные организации. Допускаю, что Союз писателей СССР как структура весьма важная для идеологии была под более пристальным вниманием КГБ чем Перхушковская фабрика культтоваров, но это вовсе не значит, что КГБ чем-то управлял. КГБ смотрел что бы с Западом не снюхивались, что очень хорошо получается у нашей интеллигенции.